| 機構名稱 | 成立時間 | 負責人 | 依托院系（學科） | 級別 |
| 食品科學與技術國家重點實驗室 | 2007.10.26 | 謝明勇 | 江南大學、南昌大學 | 國家級平臺 |
| 國家硅基LED工程技術研究中心 | 2011.1.7 | 江風益 | 材料科學與工程學院 | 國家級平臺 |
| 食品科學教育部重點實驗室 | 2002 | 謝明勇 | 生命科學與食品工程學院 | 部級平臺 |
| 鄱陽湖環境與資源利用教育部重點實驗室 | 2007.11.1 | 黃云 | 環境與化學工程學院 | 部級平臺 |
| 發光材料與器件教育部工程研究中心 | 2001 | 江風益 | 材料科學與工程學院 | 部級平臺 |
| 生物質轉化教育部工程研究中心 | 2006.6.27 | 生命科學與食品工程學院 | 部級平臺 | |
| 江西省食品生物技術重點實驗室 | 2000 | 陳紅兵 | 中德聯合研究院 | 省級平臺 |
| 江西省發光材料重點實驗室 | 2000 | 張萌 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省分子醫學重點實驗室 | 2001.11 | 戴育成 | 第二附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省機器人與焊接自動化重點實驗室 | 2002 | 張華 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省鄱陽湖綜合治理與資源開發重點實驗室 | 2003 | 黃云 | 南昌大學、江西師范大學、省山江湖辦 | 省級平臺 |
| 江西省分子生物學與基因工程重點實驗室 | 2005.3 | 朱友林 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省消化病研究重點實驗室 | 2005.3 | 呂農華 | 第一附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省神經科學重點實驗室 | 2010.9.27 | 李葆明 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省地球空間信息重點實驗室 | 2010.9.27 | 鄧曉華 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省植物資源重點實驗室、江西省廬山植物園 | 2010.9.27 | 楊柏云 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省醫學生物高技術重點實驗室 | 2001 | 李文林 | 江西省醫學科學研究院 | 省級平臺 |
| 江西省制造業信息化工程技術研究中心 | 2002 | 辛勇 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省生物質轉化工程技術研究中心 | 2004.1 | 南昌大學 | 省級平臺 | |
| 江西省汽車電子工程技術研究中心 | 2007.12.21 | 黃菊花 | 南昌大學、江鈴汽車集團公司 | 省級平臺 |
| 江西省心臟血管疾病工程技術研究中心 | 2009.12 | 程小曙 | 第二附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省嵌入式系統工程技術研究中心 | 2009.11 | 李立宏 | 南昌大學、中興長天信息技術有限公司、中興軟件技術有限公司 | 省級平臺 |
| 江西省半導體發光材料工程技術研究中心 | 2000 | 江風益 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省轉化醫學工程技術研究中心 | 2010.9.27 | 辛洪波 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省新能源化學重點實驗室 | 2011.9.30 | 陳義旺 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省高性能精確凝固成形重點實驗室 | 2011.9.30 | 楊湘杰 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省臨床藥物代謝動力學重點實驗室 | 2011.9.30 | 熊玉卿 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省心血管系統重點實驗室 | 2011.9.30 | 洪葵 | 第二附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省再生醫學工程技術研究中心 | 2011.9.30 | 王共先 | 第一附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省呼吸病重點實驗室 | 2011.11.23 | 張偉 | 第一附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省微尺度交叉科學重點實驗室 | 2012.8.20 | 鄭泉水 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省基礎藥理學重點實驗室 | 2012.8.20 | 何明 | 南昌大學 | 省級平臺 |
| 江西省智能信息系統重點實驗室 | 2012.8.20 | 南昌大學 | 省級平臺 | |
| 江西省創面修復工程技術研究中心 | 2012.8.20 | 郭光華 | 第一附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省肝膽疾病工程技術研究中心 | 2012.8.20 | 邵江華 | 第二附屬醫院 | 省級平臺 |
| 江西省眼科學與視覺科學研究所 | 2012 | 易敬林 | 附屬眼科醫院 | 省級平臺 |
| 江西省血液學重點實驗室 | 2013 | 第二附屬醫院 | 省級平臺 | |
| 江西省人工關節工程技術研究中心 | 2013 | 第一附屬醫院 | 省級平臺 | |
| 江西省眼科學重點實驗室 | 2013 | 易敬林 | 附屬眼科醫院 | 省級平臺 |
| 江西省高等學校高分子及應用催化重點實驗室 | 2005 | 陳義旺 | 材料科學與工程學院 | 廳級平臺 |
| 江西省高等學?，F代機械設計工程技術研究中心 | 2005 | 劉瑩 | 機電工程學院 | 廳級平臺 |
| 江西省高等學校微納米科學與技術重點實驗室 | 2008.8.7 | 王立 | 高等研究院 | 廳級平臺 |
| 江西省高等學校太陽能光伏技術工程技術研究中心 | 2008 | 周浪 | 南昌大學光伏研究院 | 廳級平臺 |
| 江西省高等學校功能雜化高分子重點實驗室 | 2009.9.1 | 陳義旺 | 理學院 | 廳級平臺 |
| 江西省高等學?；A醫學重點實驗室 | 梁尚棟 | 醫學部 | 廳級平臺 | |
| 中德聯合研究院 | 1988 | 陳紅兵 | 南昌大學 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學材料科學研究所 | 1994 | 王立 | 材料科學與工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學稀土與微納功能材料研究中心 | 1995 | 李永繡 | 理學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學應用化學研究所 | 1994 | 張寧 | 理學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學近代物理研究所 | 1996 | 劉正東 | 理學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學中德食品工程中心 | 2001 | 劉成梅 | 生命科學與食品工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學機械電子研究所 | 1993 | 張華 | 機電工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學計算機技術工程研究所 | 1994 | 羅建平 | 信息工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學鄱陽湖研究中心 | 2003 | 黃云 | 環境與化學工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學設計研究院 | 1963 | 賈益綱 | 建筑工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學軍工研究院 | 2006.8.9 | 劉衛東 | 機電工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學高等研究院 | 2007.1.13 | 鄭泉水 | 南昌大學 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學LDK太陽能研究中心 | 2007.2.14 | 周浪 | 材料科學與工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學芯片設計研究中心 | 2007.9.12 | 理學院 | 校級獨立機構 | |
| 南昌大學物聯網與智能計算研究中心 | 2007.9.12 | 李建民 | 信息工程學院、軟件學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學鐵道裝備工程研究中心 | 2009.3.21 | 陶捷 | 機電工程學院，信息工程學院，建工學院，環境與化學工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學轉化醫學研究院 | 2010.2.8 | 辛洪波 | 醫學部、生命科學與食品工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學生命科學研究院 | 2010.2.8 | 李葆明 | 生命科學與食品工程學院、醫學部 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學空間科學與技術研究院 | 2010.2.8 | 鄧曉華 | 信息工程學院、機電工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學鋰電及新能源汽車研究院 | 2011.5.8 | 楊湘杰 | 機電工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學信息科學與技術研究院 | 2012.11.20 | 信息工程學院 | 校級獨立機構 | |
| 南昌大學綠色建筑技術研究院 | 2012.12.18 | 姜漪 | 建筑工程學院 | 校級獨立機構 |
| 南昌大學免疫與生物治療研究所 | 2013.3.16 | 江西省醫學科學研究院 | 校級獨立機構 | |
| 江西省太陽能光伏重點實驗室 | 2008 | 周浪 | 南昌大學光伏研究院 | 省級平臺 |
| 南昌大學光伏研究院 | 2014 | 周浪 | 材料科學與工程學院 | 校級獨立機構 |
| 人類衰老研究所 | 2015.09 | 田小利 | 生命科學學院 | 校級獨立機構 |
| 江西省人類衰老重點實驗室 | 2018.09 | 田小利 | 生命科學學院 | 省級科研平臺（省重點實驗室） |
| 江西省流域生態演變與生物多樣性重點實驗室 | 2018.09 | 戎俊 | 生命科學研究院 | 省級平臺 |